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Atlas of Chinese Medicinal Plants Chloroplast Genome (Vol.1)《中国药用植物叶绿体基因组图谱.第一册》作为“千种药用植物基因组研究计划”的研究成果之一，关注的是药用植物叶绿体基因组的结构解析、特征描述和功能阐释。《中国药用植物叶绿体基因组图谱.第一册》分为总论、各论和附录3部分：总论（第一章至第三章）介绍药用植物叶绿体的功能结构特征、相关研究进展，以及叶绿体基因组在药用植物系统发育、物种驯化、物种鉴定与基因工程等领域的应用。各论对53种药用植物及其叶绿体基因组图谱进行了详细描述，内容包括药用植物基本信息、主要品种及分布；叶绿体基因组基本信息、编码基因、重复序列、微卫星重复序列、多态性、高可变区、进化树、分子标记。附录对《中国药用植物叶绿体基因组图谱.第一册》相关术语进行了注释，列出了《中国药用植物叶绿体基因组图谱.第一册》物种的索引。《中国药用植物叶绿体基因组图谱.第一册》是药用植物基因组学领域首部系统性研究专著，为全面阐释药用植物的遗传密码奠定了基础。

 

目录

上篇 总论 1

第一章 绪论 3

第一节 叶绿体及其基因组 3

第二节 叶绿体基因组图谱及应用 7

第二章 叶绿体基因组图谱的构建原理与方法 16

第一节 标本采集及DNA提取 16

第二节 第二代测序文库的构建与测序 18

第三节 叶绿体基因组的组装 22

第四节 叶绿体基因组注释 24

第五节 重复序列的类型及其发现 27

第六节 宏DNA条形码 29

第三章 叶绿体基因组常用生物信息分析软件 33

第一节 叶绿体基因组组装软件 33

第二节 叶绿体基因组注释软件 46

第三节 叶绿体基因组分析软件 52

下篇 各论 59

1 川贝母 61

2 大麦 72

3 北马兜铃 78

4 蒜 84

5 丹参 92

6 巴戟天 98

7 白及 104

8 白木通 110

9 艾 116

10 白头翁 124

11 吊石苣苔 130

12 杭白芷 136

13 白茅 142

14 石斛 148

15 红花 155

16 地黄 161

17 杜仲 168

18 川赤芍 174

19 赤豆 182

20 土沉香 189

21 连翘 196

22 花椒 202

23 卷丹 208

24 细辛 220

25 金毛狗 228

26 垂盆草 234

27 金荞麦 239

28 金钱松 245

29 黄花蒿 251

30 茶 259

31 北乌头 266

32 华中五味子 274

33 穿心莲 280

34 厚朴 286

35 荔枝 298

36 茴香 304

37 独蒜兰 310

38 莲 316

39 粗茎秦艽 323

40 海金沙 330

41 胡桃 335

42 黄连 342

43 黄芩 348

44 黄精 355

45 黄檗 363

46 构树 369

47 蓖麻 375

48 榧树 382

49 辣椒 389

50 稻 397

51 鳢肠 404

52 柑橘 410

53 藁本 418

附录 425

 

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